SELEX法

SELEX法の原理

　SELEX (Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment) 法は，1990年代に確立された実験法で，in vitro selection法とも言われ，色素，アミノ酸，タンパク質に結合する核酸リガンド （アプタマー）の実体を明らかにする方法である．リガンドとなる核酸を微量精製（選別）したうえで，PCRを用いて 指数関数的に増幅し，この過程をシステマティックに複数回繰り返すことによって，至適結合配列をもつ核酸分子を同定する． この原理を模式的に表したのが上の図である．

　当研究室では，転写因子の機能を同定するためにこのSELEX法を用いている． また，SELEX法を改良したGenomic SELEX法を用いた解析も行っている．Genomic SELEX法は，解析に用いるさまざまな配列 パターンをもったRandom DNA poolを標的タンパク質のGenome DNAを用いて調製する方法である（下の図参照）． このGenomic SELEX法の利点としては，ノイズが少ないということ，ゲノム上の作用部位（オペレーター部位） を同時に決められるという点が挙げられる．当研究室では，このGenomic SELEX法を用いて，いくつかの転写因子について そのオペレーター部位を明らかにした．

Genomic SELEX法のRandom DNA pool調製法

References